二手商铺的税费计算如下：

买家税费

印花税 ：转让收入的0.05%。

契税：

转让收入的3%。

房地产交易手续费：

3元/平方米。

房屋登记费：

550元/本。

权证印花税：

5元/本。

卖家税费

印花税：

转让收入的0.05%。

个人所得税

提供发票：转让收入减去房产原值再乘20%。

不提供发票：转让收入乘7.5%再乘20%。

土地增值税

提供发票：按四级累进计算法，增值50%以下按差额30%，增值50-100%以下按差额40%，增值100-200%以下按差额50%，增值200%以上按差额60%征收。

不提供发票：转让收入减转让收入乘90%再乘30%。

营业税及附加税

提供发票：转让收入减去上手发票价再乘5.5%。

不提供发票：转让收入乘5.5%。

土地出让金：

商业用途用房，按其网格点基准地价的35%计收；商业路线价区段路的商业临街宗地，加收路线价的10%；办公用途用房按其网格点基准地价的30%计收。土地出让金契税：按本次征收土地出让金价款的3%征收。

注意事项

税费的计算可能因地区和具体情况有所不同，建议在交易前咨询当地税务部门或专业税务顾问。

提供发票和不提供发票的情况下，各项税费的计算方法和税率有所差异，需按照相关规定执行。